123pracovat

• Provádění analýzy NGS dat z různých přístrojových platforem (Illumina, Oxford Nanopore, PacBio) a pro různé NGS aplikace (genom, mikrobiom, metagenom, exom, transkriptom atd.).

• Návrh řešení pro specifická zadání, vlastní analýza dat a její následná automatizace.

• Vývoj bioinformatických postupů pro analýzu sekvenačních dat.

• Tvorba a správa databází a reportů.

• Tvorba a rozvoj infrastruktury pro analýzu dat.

Požadavky:

• VŠ - bioinformatika a biostatistika, popř. přírodní vědy s bohatou zkušeností v oblasti bioinformatiky

• Zkušenosti s velkými objemy biologických dat

• Znalost programovacích jazyků R, python a bash/shell.

• Znalost text miningu a data miningu výhodou

• Aktivní znalost s open source nástroji pro zpracování NGS dat (například GATK, Trinity, Trinonate, Qiime2, BWA, Bowtie, TopHat, STAR, SPAdes, apod.)

• Znalost workflow management systemů výhodou (Snakemake, Nextflow, apod.).

• Znalost laboratorních technik Next generation sekvenování a praktická laboratorní zkušenost výhodou

• Schopnost pracovat samostatně, pečlivě, aktivně a zodpovědně na svěřených úkolech

• Excelentní komunikační a prezentační schopnosti, znalost angličtiny slovem i písmem

Nabízíme:

• Práce v menší soukromé firmě

• Flexibilní pracovní doba, možnost práce na částečný úvazek, částečně z domova nebo formou externí spolupráce

• Finanční ohodnocení dle sjednané délky pracovní doby, zkušeností a výkonu

• Možnost odborného vzdělávání a rozvoje, pravidelná školení

• Místo výkonu práce: Dobříš, home office

• Nástup: kdykoliv

Máte zájem pracovat v SEQme?

Neváhejte a kontaktujte nás.

Rádi Vás poznáme.

Sylvie Nádvorníková

career@seqme.eu